Чому нормалізація результатів аналізів потребує більшого, ніж назва біомаркера
Два лабораторні звіти можуть начебто містити однаковий аналіз, водночас описуючи спостереження, які не варто об’єднувати автоматично.
Опубліковано BioReport Остання перевірка:
Надрукована назва — лише одна з підказок. Тип зразка, вимірювана властивість, час, шкала, метод, одиниця вимірювання та контекст джерела можуть впливати на те, що означає результат і чи може він увійти до спільної історії в часі.
LOINC допомагає системам точніше ідентифікувати лабораторні та клінічні спостереження. Це важлива частина нормалізації, але сам по собі код LOINC не робить кожну пару числових результатів безпосередньо порівнянними.
Що таке LOINC?
LOINC означає Logical Observation Identifiers Names and Codes. Цей стандарт надає універсальні ідентифікатори та назви для лабораторних і інших клінічних спостережень.
Згідно з офіційним Посібником користувача LOINC, повністю визначена назва LOINC складається з п’яти або шести основних частин:
- Компонент — аналіт або спостереження, наприклад глюкоза.
- Властивість — який тип величини чи характеристики вимірюється.
- Часовий аспект — чи є спостереження миттєвим, чи охоплює інтервал.
- Система або зразок — зразок чи система, наприклад сироватка, плазма або сеча.
- Шкала — як виражено результат, наприклад кількісно або порядково.
- Метод — як було виконано спостереження, коли техніка змінює його клінічну інтерпретацію.
Метод є необов’язковим у повністю визначеній назві, коли він не потрібен для розрізнення спостереження.
Основні частини терміна LOINC · Отримання LOINC – Умови використання
Чому надрукованих назв аналізів недостатньо
Звіт може використовувати коротку назву, наприклад «глюкоза», але ця назва не обов’язково повідомляє системі:
- який зразок було досліджено;
- чи було спостереження миттєвим або зібраним за інтервал;
- яку властивість виміряно;
- чи потрібен специфічний для методу код;
- чи використовують два значення сумісні одиниці;
- чи описують обидва звіти одне й те саме клінічне спостереження.
Нормалізацію не варто реалізовувати як простий словник, що замінює кожну відому надруковану назву одним фіксованим кодом. Офіційний процес зіставлення LOINC вимагає вибору активного терміна, який найкраще описує локальне спостереження. LOINC публікує тематичні посібники зі зіставлення та рекомендує зберігати достатньо інформації про локальний тест, щоб вибирати серед термінів-кандидатів.
Зіставлення та LOINC · Посібники зі зіставлення LOINC · Зіставлення вашого локального терміна з терміном LOINC
Ідентифікація — не те саме, що числова порівнянність
LOINC ідентифікує, що саме спостерігалося. Трекер історії повинен окремо визначити, чи можна порівнювати зазначені значення чисельно. Це рішення може вимагати:
- сумісних одиниць і коректного перетворення між одиницями;
- сумісного контексту зразка та методу;
- збереження референсних інтервалів конкретної лабораторії;
- усвідомлення, що методи чи калібрування можуть змінюватися;
- доступу до оригінального звіту, коли автоматичне виділення даних непевне.
LOINC може допомогти встановити семантичну ідентичність. Сам по собі він не доводить, що два числа взаємозамінні.
Яку роль відіграє UCUM
UCUM, Unified Code for Units of Measure, призначений для однозначної електронної комунікації величин і одиниць.
LOINC: Яке лабораторне чи клінічне спостереження це є?
UCUM: Як пов’язана одиниця представлена для машинної комунікації?
Нормалізація одиниць повинна залишатися розмірно та клінічно коректною. Система не повинна перетворювати чи об’єднувати значення лише тому, що їхні надруковані назви виглядають схоже.
Обережний процес поздовжньої нормалізації
1. Збережіть оригінальний звіт
Зберігайте вихідний документ, дату забору, надруковану назву тесту, значення, одиницю, референсний інтервал та наявний контекст лабораторії.
2. Виділіть структуровані кандидати
Розберіть звіт на спостереження-кандидати без відкидання оригінальних формулювань. Позначайте непевне або неповне виділення для перевірки замість того, щоб мовчки вигадувати контекст.
3. Ідентифікуйте спостереження
Використовуйте наявну інформацію про компонент, властивість, час, зразок, шкалу та метод, щоб обрати відповідний активний термін LOINC. Не форсуйте зіставлення, коли у звіті недостатньо інформації.
4. Нормалізуйте одиниці окремо
Представляйте одиниці послідовно лише тоді, коли відома вихідна одиниця та існує коректне перетворення. Зберігайте і вихідне значення, і будь-яке нормалізоване представлення.
5. Визначте, чи належать результати одному трендові
Перед об’єднанням результатів у поздовжню серію перевірте семантичну ідентичність, сумісність одиниць та відповідні відмінності методу чи зразка.
6. Зберігайте походження видимим
Користувачі повинні мати можливість повернутися від точки на графіку до звіту-джерела з датою та його оригінального контексту.
Як BioReport використовує цю ідею
BioReport імпортує підтримувані PDF-звіти лабораторій, упорядковує виділені біомаркери та використовує нормалізацію LOINC для підтримки відстеження в часі.
Не кожен звіт, спостереження чи одиницю можна нормалізувати автоматично. Покриття та якість зіставлення залежать від документа-джерела та доступного контексту. Важливі значення варто перевіряти за оригінальним лабораторним звітом.
Чого LOINC не надає
LOINC не:
- діагностує медичний стан;
- визначає, чи є результат здоровим чи нездоровим;
- призначає лікування;
- гарантує, що два числові значення можна об’єднати;
- замінює оригінальний лабораторний звіт;
- усуває потребу в професійній клінічній інтерпретації.
Поширені запитання
Чи завжди один біомаркер зіставляється з одним кодом LOINC?
Ні. Схожі надруковані назви можуть позначати спостереження, які відрізняються властивістю, часом, зразком, шкалою або методом.
Чи означає спільний код LOINC, що два значення мають однакову одиницю?
Не обов’язково. Представлення одиниць і числова порівнянність повинні оцінюватися окремо.
Чи може LOINC стандартизувати референсні діапазони?
LOINC ідентифікує спостереження; він не замінює референсний інтервал, наданий лабораторією. Референсні інтервали можуть відрізнятися залежно від методів лабораторії та контексту пацієнта.
Чи повинне програмне забезпечення вгадувати код LOINC за відсутності контексту?
Обережна система повинна зберегти вихідне спостереження та позначити невизначеність замість того, щоб подавати непідтверджене зіставлення як певне.
Чи є LOINC безкоштовним для використання?
LOINC доступний безкоштовно для комерційного та некомерційного використання за його ліцензією. Застосовуються умови атрибуції та інші положення, а чинну ліцензію слід переглянути перед поширенням вмісту LOINC.
Чи навчаєте ви ШІ на моїх даних?
Ні. BioReport не використовує ваші документи, результати аналізів, персональні чи медичні дані, а також отримані з ваших завантажень анонімізовані, агреговані чи знеособлені дані для навчання, донавчання чи оцінювання моделей ШІ — ні власних, ні сторонніх. Наші постачальники ШІ можуть обробляти дані лише для надання Сервісу й не мають права використовувати їх для навчання своїх моделей.
Освітня інформація, а не медична порада.
Пов’язані матеріали
Сценарій використання
Порівнюйте результати аналізів у різних лабораторіях і в часі
Дізнайтеся, як зберігати звіти з різних дат і лабораторій разом та повертатися до їхнього контексту.
Остання перевірка:
Впорядковуйте результати аналізів у часі
Зберігайте підтримувані лабораторні звіти та їхній контекст разом у BioReport.
Створити безкоштовний акаунт · Порівнюйте результати аналізів у часі